Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms