Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms