Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms