Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSSK4Q6SA08 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms