Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC174Q6PII3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms