Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms