Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms