Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms