Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms