Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms