Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF20Q5VT98 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms