Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 EFL1-201ENST00000268206 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms