Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL1Q5TGJ6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms