Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCID2Q5JVF3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms