Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RPL39P5Q59GN2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RPL39P5Q59GN2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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