Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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