Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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