Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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