Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFE2Q16621 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms