Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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