Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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