Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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EXT1Q16394 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXT1Q16394 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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