Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms