Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CST6Q15828 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CST6Q15828 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CST6Q15828 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CST6Q15828 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CST6Q15828 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CST6Q15828 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms