Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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