Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SS18Q15532 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SS18Q15532 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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