Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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