Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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