Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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