Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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