Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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COL9A2Q14055 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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COL9A2Q14055 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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COL9A2Q14055 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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COL9A2Q14055 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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COL9A2Q14055 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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