Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCINQ13939 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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