Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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