Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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