Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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