Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PWP1Q13610 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms