Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNW1Q13573 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms