Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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