Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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PKD2Q13563 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
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PKD2Q13563 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2Q13563 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
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