Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms