Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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