Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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