Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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RESTQ13127 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RESTQ13127 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RESTQ13127 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RESTQ13127 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RESTQ13127 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RESTQ13127 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RESTQ13127 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RESTQ13127 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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RESTQ13127 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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RESTQ13127 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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RESTQ13127 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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RESTQ13127 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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RESTQ13127 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RESTQ13127 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RESTQ13127 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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RESTQ13127 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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RESTQ13127 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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RESTQ13127 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RESTQ13127 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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RESTQ13127 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RESTQ13127 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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