Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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