Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms