Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TROQ12816 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TROQ12816 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROQ12816 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROQ12816 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROQ12816 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROQ12816 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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