Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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