Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms