Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMAGPQ0VAQ4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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