Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms